1966년에 클라미디오타(Chlamydiota)가 박테리아로 인식되었고 클라미디아 속(genus Chlamydia)이 확인되었습니다. 클라미디아 목은 1971년 Storz와 Page에 의해 만들어졌습니다. 클라미디아 클래스는 최근에 합법적으로 출판되었습니다.1989년부터 1999년 사이에 새로운 과, 속, 종이 인식되었습니다. 클라미디아 문은 Bergey의 체계적 세균학 매뉴얼(Manual of Systematic Bacteriology) 에 확립되어 있습니다 . 2006 년까지 350개 이상의 클라미디아 계통에 대한 유전 데이터가 보고되었습니다.2020년에 보고된 해저 형태의 발견에는 새로운 계통군이 포함됩니다 . 2022년에 문은 Chlamydiota로 이름이 변경되었습니다.
Chlamydiota에는 현재 유효한 이름이 붙은 8속과 14속이 포함되어 있습니다.문은 현재 2개의 목(Chlamydiales, Parachlamydiales)과 단일 강(Chlamydiia) 내의 9개 과로 구성되어 있습니다.이 과 중 4개 과( Chlamydiaceae , Parachlamydiaceae , Simkaniaceae , Waddliaceae ) 만이 유효하게 명명되었으며 5개 과( Clavichlamydiaceae , Criblamydiaceae , Parilichlamydiaceae , Piscichlamydiaceae 및 Rhabdochlamydiaceae ) 로 기술되었습니다 .
최근에 기술된 클라미디아목에는 클라미디아과(Chlamydiaceae)와 클라비 클라미디아과( Clavichlamydiaceae) 가 포함되어 있으며, 새로운 파라클라미디아목(Paranchlamydiales Order)에는 나머지 7개 과가 포함되어 있습니다.이 제안은 과 수준 이상의 분류학적 순위를 보장하는 두 가지 서로 다른 계통발생 계통의 관찰에 의해 뒷받침됩니다. 보존된 indel (CSI) 및 단백질(CSP) 형태의 분자 서명은 각 목에서 고유하게 공유되는 것으로 밝혀졌으며, 이는 각 계통을 다른 계통과 구별하고 각 계통 내 공통 조상에 대한 견해를 뒷받침하는 수단을 제공합니다. 주문하다. 두 목의 구별성은 다른 과 조합 중에서 CSI가 발견되지 않았다는 사실에서도 뒷받침됩니다.
클라미디아과(Chlamydiaceae)에만 있는 분자 특징 도 발견되었습니다. 클라미디아과(Chlamydiaceae)는 원래 클라미디아( Chlamydia) 라는 한 속으로 구성되었으나 1999년에 클라미도필라( Chlamydophila ) 와 클라미디아( Chlamydia) 라는 두 속으로 분리되었습니다 . 2015년 이후 이 속은 Chlamydophila 속에 속하는 종이 Chlamydia 종으로 재분류되면서 재결합되었습니다.
그러나 CSI 및 CSP는 Chlamydophila 종에 대해 특별히 발견되어 Chlamydia와의 구별성을 뒷받침하며 아마도 가족 내에서 두 개의 별도 그룹에 대한 추가 고려가 필요합니다. 모든 클라미디아가 독점적으로 공유하는 CSI 및 CSP도 발견되었으며, 이는 클라미도필라와 독립된 계통을 나타내며, 이는 클라미디아 종을 이웃 클라미도필라 구성원과 구별하는 수단을 뒷받침합니다.
클라미디오타(Chlamydiota)는 약 10억년 전에 다른 박테리아로부터 분리된 독특한 박테리아 진화 그룹을 형성하며 여러 CSI 및 CSP의 존재로 구별될 수 있습니다. 이 그룹의 종은 여러 단백질에 보존된 삽입결실이 존재하고 다른 클라미디아 종에 고유하게 존재하는 다수의 특징 단백질에 의해 다른 모든 박테리아와 구별될 수 있습니다. .Chlamydiota가 Planctomycetota 또는 Spirochaetota 와 관련이 있는지에 대한 보고는 다양합니다 .